Differentiation of Meloidogyne Species With Fame Analysis [DIFERENCIACIÓN DE ESPECIES DE MELOIDOGYNE POR ANÁLISIS DE METIL ÉSTERES DE ÁCIDOS GRASOS]

N. S. Sekora, K. S. Lawrence, P. Agudelo, E. van Santen, J. A. McInroy

Abstract


Sekora, N. S., K. S. Lawrence, P. Agudelo, E. van Santen, and J. A. McInroy. 2010. Differentiation of Meloidogyne species with FAME analysis. Nematropica 40:163-175. Fatty acid methyl ester (FAME) analysis can be used as a means for differentiating among plantparasitic nematode genera. The objective of this study was to evaluate the use of this system to identify species and races within a single genus. Fatty acids were extracted and analyzed from samples containing 1000 individuals each of Meloidogyne arenaria (race 2), M. hapla, M. incognita (races 1, 2, and 3), and M. javanica. The resulting profiles generated by the Sherlock® Analysis Software were then statistically analyzed with SAS version 9.1.3. The profiles of each Meloidogyne species and race were significantly different. The four Meloidogyne species separated with a minimum squared Mahalanobis distance (D2) between M. incognita and M. arenaria (D2 = 15.9,P< 0.0001). D2 values among M. incognita races were all significant at P< 0.0001 with a minimum distance between M. incognita race 1 and M. incognita race 2 of 17.5. When separating three Meloidogyne species and three M. incognita races, the minimum distance lied between M. arenaria and M. incognita race 1 (D2 = 15.7, P< 0.0001). By incorporating these profiles into a Sherlock® Analysis Software library, the FAME method can be used to distinguish among four Meloidogyne species to provide an alternative source of identification.

Sekora, N. S., K. S. Lawrence, P. Agudelo, E. van Santen, and J. A. McInroy. 2010. Diferenciación de especies de Meloidogyne por análisis de metil ésteres de ácidos grasos. Nematropica 40:163-175. El análisis de metil ésteres de ácidos grasos (FAME) se puede usar como método de diferenciación de géneros de nematodos fitoparásitos. El objetivo de este estudio fue evaluar este sistema para identificar especies. Se extrajeron y analizaron ácidos grasos de muestras con 1000 individuos cada una de Meloidogyne arenaria (raza 2), M. hapla, M. incognita (razas 1, 2, y 3), y M. javanica. Los perfiles generados por Sherlock® Analysis Software se analizaron estadísticamente y se encontró que los perfiles para cada especie y raza de Meloidogyne son significativamente diferentes. Las cuatro especies de Meloidogyne se separaron con una distancia de Mahalanobis al cuadrado (D2) mínima de 15.9 entre M. incognita y M. arenaria (P< 0.0001). Los valores de D2 entre razas de M. incognita fueron significativos ( P< 0.0001) con una distacia minima entre M. incognita raza 1 y M. incognita raza 2 de 17.5. Al separar las especies de Meloidogyne y las tres razas de M. incognita, la menor distancia se observó entre M. arenaria y M. incognita raza 1 (D2 = 15.7, P< 0.0001). Si se incorporan estos perfiles en una biblioteca de Sherlock® Analysis Software, el sistema FAME se puede usar para distinguir estas cuatro especies de Meloidogyne, brindando así un método alternativo de identificación.

Full Text:

PDF